Gestión de la incertidumbre taxonómica

La identificación de especies es un proceso complejo. Las especies se describen generalmente a partir de un conjunto de caracteres identificados en una descripción publicada y vinculados a un espécimen tipo conservado en una colección científica, el cual se utiliza para validar dicha identificación. Cuando los taxones son muy similares o se requiere un conjunto de rasgos complejos para una identificación correcta, la falta de conocimientos taxonómicos específicos por parte de quienes publican los datos puede llevar a una identificación errónea. Como usuarios, deben comprender claramente cómo se realizan las determinaciones taxonómicas para su grupo de interés:

Si considera que existe el riesgo de que las especies se identifiquen incorrectamente, puede adoptar un enfoque conservador con los datos que utilice y usar únicamente aquellos vinculados a especímenes de colecciones donde sea posible la validación taxonómica, eliminando otras fuentes de datos. Otra opción es utilizar datos asociados, como información del recolector, medios de cultivo, secuencias de ADN, etc., para validar la determinación taxonómica.

La sinonimia surge cuando una misma especie ha sido descrita varias veces y se le asigna un nombre diferente en cada descripción, o cuando se produce un cambio en su taxonomía; por ejemplo, cuando una especie pasa de un género a otro. Solo se acepta un nombre de especie, y los demás se denominan sinónimos. Estos sinónimos pueden seguir utilizándose en mayor o menor medida, por lo que al obtener datos de GBIF debe asegurarse de obtener la información correspondiente al nombre taxonómico que necesita. La estructura taxonómica de GBIF distingue entre nombres científicos aceptados y sinónimos, así como identificadores únicos en forma de claves taxonómicas. La búsqueda de especies en https://www.gbif.org/species/search permite filtrar por nombres aceptados y sinónimos, y las claves taxonómicas pueden utilizarse para realizar búsquedas programáticas en GBIF.

Los nombres científicos pueden resultar confusos. Si accede a los datos de GBIF mediante programación, en lugar de a través del sitio web, las claves taxonómicas son una forma eficaz de definir búsquedas basadas en la taxonomía. Estas claves se emiten a nivel de especie, género, familia, orden, filo y reino. Se asignan identificadores únicos a los nombres aceptados, y sus sinónimos reciben el mismo identificador. Por lo tanto, puede ser útil ordenar las especies según sus claves taxonómicas únicas, proporcionadas durante la indexación del conjunto de datos por GBIF.

Puede haber casos en los que el nombre científico no coincida con ningún nombre en la base de datos de GBIF, quizás porque la especie se ha descrito recientemente o no figura en una lista de verificación utilizada por GBIF para construir su base de datos. Estos nombres se marcan con la bandera TAXON_MATCH_HIGHERRANK, que indica que el nombre científico no se ha reconocido, pero que el dato coincide a un nivel taxonómico superior, por ejemplo, género o familia. Esta bandera se puede utilizar para identificar y filtrar estos datos. Cuando los nombres están mal escritos o tienen un formato incorrecto, también existe la bandera TAXON_MATCH_FUZZY, que se puede utilizar para identificar y filtrar nombres que solo coinciden con la base de datos taxonómica mediante una coincidencia aproximada, no exacta.