Publicación de datos

En términos sencillos, la publicación de datos consiste en hacer a su(s) conjunto(s) de datos de biodiversidad públicamente accesibles y plausibles de ser descubiertos en un formato estandarizado.

La mayoría de las organizaciones de la red GBIF, también conocidas como publicadores, utilizan una herramienta integrada de publicación (IPT, por sus siglas en inglés), como Integrated Publishing Toolkit, para publicar sus datos. Estos publicadores pueden optar por alojar su propia instalación de una IPT, como el Field Museum, pero generalmente prefieren encontrar un proveedor adecuado para sus actividades de publicación de datos. Esto podría ser a través de un nodo participante de GBIF ya establecido, como GBIF Francia, o a través de un grupo temático consolidado, como VertNet. Otra opción sería utilizar uno de los IPT alojados en la nube de GBIF.

Una parte importante de la misión de GBIF es promover una cultura en la que las personas reconozcan los beneficios de publicar datos de biodiversidad de acceso abierto, tanto para ellas mismas como para la sociedad en general.

Dar una visibilidad y reconocimiento adecuados a los publicadores de datos es de suma importancia para GBIF. Por ello, la organización ha establecido los marcos normativos y técnicos necesarios para que citar y seguir el uso de los datos digitales sea más fácil que nunca.

Memorando de entendimiento de GBIF

GBIF es una iniciativa multilateral establecida por un acuerdo intergubernamental y basada en un "Memorando de entendimiento" (Memorandum of Understanding o MoU). El MoU es el documento oficial que los países y las organizaciones internacionales firman para unirse a GBIF.

El MoU es muy claro al afirmar que los editores de datos de GBIF deben ser reconocidos por sus contribuciones:

GBIF se esfuerza por hacer todos los esfuerzos posibles para que esta afirmación sea una realidad.

El acuerdo del usuario de datos GBIF

Antes de acceder a cualquier dato usando GBIF, los usuarios deben aceptar un acuerdo de usuario de datos que incluye requisitos muy específicos sobre la citación del origen de los datos a los que se accede a través de GBIF. Estos son algunos de los requisitos enumerados en el acuerdo:

“Los usuarios deben reconocer públicamente, siguiendo la convención científica de citar las fuentes junto con el uso de los datos, a los Publicadores de Datos cuyos datos de biodiversidad han utilizado, cuando sea apropiado mediante el uso de un Identificador de Objetos Digital (DOI) que se aplique al/los conjunto(s) de dato(s) y/o a las descargas de datos.”

Del mismo modo, el acuerdo es muy específico al afirmar que deben respetarse las condiciones establecidas en las licencias seleccionadas por el publicador de los datos.

Citación

GBIF alienta a todos los usuarios a que citen los datos obtenidos a través de la red de GBIF. Para ello, proporciona citas recomendadas en el conjunto de datos, los registros biológicos y las páginas de descarga de GBIF.org.

Esto es especialmente relevante para los conjuntos de datos publicados usando las licencias “CC-BY” y “CC-BY-NC”, que incluyen requisitos específicos para citar el origen de los datos.

Los textos de las citas y derechos se generan automáticamente para los publicadores de datos para cada conjunto de datos cuando se utiliza el IPT como mecanismo de publicación, siempre que se seleccione una de las licencias estándar.

Los publicadores de datos deben seleccionar cuidadosamente qué licencia se alinea mejor con cualquier requerimiento existente por parte de sus instituciones y con cualquier política de acceso a datos a la que puedan estar sujetos.

Página del publicador de datos

Todos los publicadores tienen su propia página en GBIF.org. Es importante que los publicadores reflexionen sobre cómo quieren aparecer en el sitio web y proporcionen información relevante sobre sus instituciones y sus equipos en el momento de registrarse. También deben esforzarse por mantener sus datos actualizados, ya que las partes interesadas utilizarán los datos de contacto de esa página para contactar al equipo responsable de la publicación de los datos.

DOI del conjuntos de datos

Cada vez que se publica una nueva versión de un conjunto de datos utilizando un IPT, se asigna un DOI (Digital Object Identifier). Como en el caso de las descargas, este identificador permite citar y rastrear fácilmente el trabajo derivado del conjunto de datos, si el usuario sigue buenas prácticas para la cita de la fuente.

Como se mencionó anteriormente, usted puede asignar un DOI mediante sitios web como doi.org/10.xxx: que siempre redireccionará a la fuente original, en este caso, la página del conjuntos de datos. También puede buscar un DOI usando una búsqueda web normal que normalmente mostrará cualquier otro recurso que cite el uso del mismo DOI como artículos o informes públicos.

Las organizaciones que deseen compartir datos a través de GBIF se pueden registrar aquí para solicitar aval como publicador de datos.

Se solicita a los futuros publicadores que diligencien un formulario en línea. Las respuestas proporcionadas ayudan a GBIF a dar crédito y atribución adecuados para los conjuntos de datos compartidos por el nuevo publicador.

Antes de que GBIF indexe los conjuntos de datos, la institución debe recibir apoyo como publicadora de datos de uno de los nodos participantes que coordine las actividades de los participantes nacionales y organizacionales de la red GBIF. Si el país aún no participa en GBIF, se solicita apoyo en nombre del editor desde la comunidad GBIF.

El procedimiento de aprobación tiene por objeto garantizar que:

Las respuestas proporcionadas también ayudarán a los usuarios a entender más sobre la procedencia de los datos compartidos a través de la red GBIF.

Asegúrese de buscar publicadores existentes antes de registrar uno nuevo para asegurarse de que el publicador no está ya registrado.

Los publicadores desempeñan un papel esencial no sólo en el intercambio de conjuntos de datos, sino también en la gestión de su calidad, completitud y utilidad, también, garantizan su integración y valor dentro de la base de conocimientos global de GBIF.

Para compartir datos a través de GBIF.org, los publicadores normalmente tienen que recopilar o transformar los conjuntos de datos existentes en un formato estandarizado. Este trabajo puede incluir el procesamiento adicional, la edición del contenido y el mapeo del contenido de un conjunto de datos a uno de los formatos de transferencia de datos disponibles, así como la publicación a través de una de las herramientas de publicación de datos disponibles, como la herramienta gratuita y de código abierto de GBIF Integrated Publishing Toolkit (IPT).

Una vez publicados, la infraestructura en tiempo real de GBIF "indexa" o "cosecha" nuevos conjuntos de datos, integrándolos en un sistema de acceso común en el que los usuarios pueden recuperar todos y cada uno de los datos a través de servicios comunes de búsqueda y descarga. A medida que se indexan los conjuntos de datos, GBIF.org realiza controles adicionales, rutinas de interpretaciones y de conversión para garantizar que los datos sean interoperables y cumplan las normas mínimas de formatos de datos, calidad de los mismos y aptitud para su uso. Sin embargo, muchos de los criterios de calidad y utilidad de los datos se manejan mejor y más fácilmente cuando se abordan en su fuente: el conjunto de datos individual.

Por lo tanto, los editores desempeñan un papel esencial no sólo en el intercambio de conjuntos de datos, sino también en la gestión de su calidad, integridad y utilidad, así como en la garantía de su integración y valor dentro de la base de conocimiento global de GBIF. Más información sobre requisitos de calidad de datos y recomendaciones para:

En la práctica, animamos a los responsables de publicar datos a que se familiaricen con los formatos de datos esperados y los requisitos de contenido lo antes posible en el proceso (ver también las plantillas de GBIF Excel preconfiguradas con los términos requeridos y recomendados para conjuntos de datos, listas de especies, y conjuntos de datos de eventos de muestreo, todos disponibles con datos de ejemplo). De este modo, se ahorrarán mucho esfuerzo que puede ser necesario en etapas posteriores, por ejemplo, al añadir conversiones de datos, capturar información para campos obligatorios o muy recomendados, o realizar y abordar las comprobaciones finales de calidad de los datos antes de su publicación.

El validador de datos de GBIF es un servicio que permite a cualquier persona con un conjunto de datos relevante para GBIF recibir un informe sobre la corrección sintáctica y la validez del contenido del conjunto de datos. Al enviar un conjunto de datos al validador, puede pasar por los procedimientos de validación e interpretación normalmente asociados a la publicación en GBIF y determinar rápidamente los posibles problemas en los datos, sin tener que publicarlos.

¿Cómo funciona?

Para empezar, cargue el archivo del conjunto de datos en el validador: 1) haciendo clic en SELECCIONAR ARCHIVO y seleccionándolo en su equipo local o 2) arrastrando el archivo desde una carpeta local y soltándolo en el icono SOLTAR AQUÍ. También puede introducir la URL de un archivo de conjunto de datos accesible desde Internet. Esto es especialmente útil para los conjuntos de datos más grandes. Una vez que haya pulsado el botón "Enviar", el validador comenzará a procesar su archivo de conjunto de datos y le llevará directamente a una página que muestra el estado de la validación.

Dependiendo del tamaño de su conjunto de datos, el procesamiento puede llevar un tiempo. No es necesario mantener la ventana del navegador abierta, ya que se emite un ID único de trabajo cada vez que se inicia un nuevo proceso de validación. Si su conjunto de datos está tardando demasiado en procesarse, simplemente guarde el ID (guardando la URL) y utilícelo para volver más tarde a ver el informe. Guardaremos el informe durante un mes, durante el cual podrá consultarlo cuando quiera.

¿Qué tipos de archivo son aceptados?

¿Qué información se proporciona del informe de validación?

Una vez que el procesamiento haya finalizado, podrá ver el informe de validación que contiene la siguiente información:

También podrá ver los metadatos como una versión preliminar de la página del conjunto de datos, tal y como aparecerá cuando el conjunto de datos se publique y se registre en GBIF.

Tengo el informe de validación, ¿Ahora qué?

Si el validador encuentra que su conjunto de datos no puede ser indexado por GBIF, debería solucionar los problemas planteados por el informe de validación antes de considerar su publicación en GBIF. Por otro lado, si obtiene luz verde y su conjunto de datos es indexable por GBIF, debe revisar cuidadosamente cualquier problema que pueda ser el resultado de, por ejemplo, errores de conversión, etc. que puedan afectar a la calidad de los datos. Si encuentra y corrige cualquier error (desde un simple error tipográfico hasta grandes problemas sistemáticos) no dude en volver a enviar su conjunto de datos tantas veces como quiera.