Acceso eficaz a los datos para la elaboración de informes

Contexto

Este tema se refiere a los enfoques para acceder de manera eficiente a los datos de GBIF con el fin de generar informes de datos. Los últimos avances en GBIF incluyen la disponibilidad de instantáneas de GBIF en infraestructuras de computación en la nube y la capacidad de consultar GBIF utilizando SQL permitiendo, por ejemplo, métricas de datos e informes de datos personalizados en lugar de descargar registros individuales. Además, los nuevos formatos de cubos de datos ofrecerán la oportunidad de analizar de forma eficiente las tendencias de la biodiversidad en datos espaciotemporales.

Metas del aprendizaje

Tras completar este módulo, usted debería ser capaz de realizar las siguientes tareas:

  • Identificar el panorama de acceso a los datos (es decir, qué herramientas están disponibles y cómo se utilizan)

  • Identificar soluciones adecuadas para determinados casos de acceso a datos

  • Obtenga información sobre codificación y rGBIF

  • Explore los flujos de trabajo reproducibles mediante secuencias de comandos

Trainers

The following trainers have developed the content for this topic:

Dag Endresen, Administrador del Nodo, Noruega

Will Morris, Administrador del Nodo, Finlandia

Consultores del Secretariado: Andrew Rodrigues y John Waller

Preparación

Completar las siguientes actividades para preparar las sesiones in situ:

  1. Proponer un caso de uso de datos/ejemplo de informe de datos para compartir como tema de debate en grupo.

  2. Crear una cuenta en GBIF.org (si aún no tiene una).

  3. Instalar software

Panorama del acceso a los datos

Introducción y tipos de datos

Esta presentación introduce el tema de la formación y proporciona una visión general de los tipos de datos que se encuentran en GBIF.

 

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=== Métodos de acceso

Esta presentación ofrece una visión general de los diversos métodos que pueden utilizarse para acceder a los datos mediados por GBIF.

 

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Ejemplos compartidos desde los nodos

Revise los ejemplos compartidos por los nodos sobre casos de uso de datos. Puede consultarlos durante la actividad de grupo para inspirarse.

 

 

=== Exploración del acceso a los datos y casos de uso

Para esta actividad, cada grupo deberá (a) explorar y discutir posibles casos de uso de acceso a datos e informes y (b) seleccionar un caso de uso de acceso a datos para trabajar durante la sección práctica.

Cada grupo debe responder/debatir lo siguiente:

  1. Ejemplos encontrados por Nodos que requieren que accedan/utilicen datos mediados por GBIF.

  2. Analice cómo los diferentes usos de los datos, los usuarios de los datos y los tipos de informes afectan al método que podría utilizar o recomendar para acceder a los datos gestionados por GBIF.

  3. Seleccione un caso de uso o un ejemplo de informe de datos de entre los analizados que pueda utilizarse en el siguiente ejercicio. En la medida de lo posible, elija un caso de uso que sea (a) relevante y (b) lo más singular posible entre los grupos.

  4. ¿Cómo abordarías el caso de uso/ejemplo de informe de datos utilizando la interfaz web, descargas de datos, interfaz API, interfaz R, acceso a la nube o descargas SQL?

  5. ¿Cuáles serían las ventajas o desventajas relativas de cada enfoque?

Al finalizar la actividad, cada grupo deberá seleccionar a un miembro para que presente el caso de uso elegido en sesión plenaria (máximo 2 minutos por grupo).

=== Caso de estudio

La conservación de los parientes silvestres de los cultivos nórdicos se presentará como un ejemplo de estudio de caso utilizando la API de GBIF.

 

 

Experiencia práctica con acceso a datos y casos de uso

Acceso a la nube y SQL

Esta presentación ofrece una visión general del acceso a los datos mediados por GBIF mediante servicios en la nube. También incluye una introducción a SQL y cómo acceder a dichos datos utilizando SQL.

 

 

=== API GBIF y rgbif

Esta presentación ofrece una visión general del acceso a los datos gestionados por GBIF mediante la API de GBIF. También incluye una descripción general del acceso a dichos datos mediante rgbif. Por último, se presentará el portal Barents IAS como ejemplo práctico utilizando rgbif.

 

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Actividad práctica

Para esta actividad, (a) los individuos estarán expuestos a la codificación y (b) como grupo comenzarán a trabajar en un flujo de trabajo replicable (por ejemplo, un script de R, etc.) para acceder a los datos mediados por GBIF.

Cada grupo debe responder/debatir lo siguiente:

  1. ¿Cómo enfocaría el ejemplo de caso de uso/informe de datos que ha comentado antes, utilizando el cliente de la API rgbif?

  2. ¿Qué beneficios se podrían obtener al programar una solución a los problemas analizados anteriormente?

  3. ¿Existen aspectos del caso de uso/ejemplo de informe de datos que no puedan abordarse utilizando rgbif o una herramienta similar?

  4. Trabajar juntos en un script(s) para abordar su caso de uso con rgbif o una herramienta similar.

Al final de la actividad, cada grupo debe elegir a un miembro del grupo para que presente sus soluciones (máximo 2 minutos por grupo).

Plan de acción

Los entrenadores concluirán el tema y ofrecerán un plan de acción para que reflexiones sobre este tema después de la formación.