Практический пример — инвазивные виды

Совет по инвазивным видам Гавайев (Hawaii Invasive Species Council, HISC) получил федеральный грант для сотрудничества со средними школами в рамках общегавайской образовательной программы по инвазивным видам. Цель проекта — повысить уровень знаний об инвазивных видах, расширить сбор данных и подготовить аннотированные таксономические списки для недостаточно изученных территорий. Для координации проекта на полную ставку нанят руководитель проекта. Управление всеми финансовыми средствами и их распределением осуществляет финансовый специалист HISC.

Руководитель Комитета по инвазивным видам (Invasive Species Committee, ISC) каждого острова получил субгрант для организации местных образовательных программ и сбора данных. В рамках этих программ старшеклассники проходили подготовку в качестве учеников-наставников (Student Mentors), чтобы помогать членам местных сообществ собирать изображения и данные. Комитет по инвазивным видам Большого острова (Big Island Invasive Species Committee, BIISC) получил дополнительный субгрант для расширения своей центральной базы данных с целью размещения данных каждого ISC, создания отдельных веб-сайтов для участвующих школ и поддержки единого поискового портала данных для государственных учреждений, широкой общественности и научных исследований.

На каждом острове были выбраны две школы, расположенные в районах, где сведения и документация об инвазивных видах были недостаточными или полностью отсутствовали. Учителя совместно со специалистом по информационно-просветительской работе (Outreach Associate) местного Комитета по инвазивным видам (Invasive Species Committee, ISC) подготовили учебные материалы по 21 наиболее значимому инвазивному виду растений, включая информацию о том, как распознавать различные стадии их жизненного цикла и какие методы борьбы с ними наиболее эффективны.

В аспирантуре Гавайского университета на Мауи (University of Hawaii in Maui, UHM) проводится курс по работе с местными сообществами. Четыре студента-ботаника этого университета в рамках итоговой аттестации по курсу проверяют правильность определений видов на основе изображений и описаний, представленных каждой школой в местный Комитет по инвазивным видам (ISC).

Учащиеся каждой школы организовали серию однодневных обследований с участием местных жителей в своих районах. Участники под руководством специалистов местного ISC по раннему выявлению инвазивных видов (Early Detection Technicians) и учеников-наставников (Student Mentors) посещали различные участки, где получали иллюстрированные определители и назначенный маршрут, по которому должны были следовать во время сбора данных. На каждом маршруте им необходимо было выявлять целевые виды и делать по 1–3 фотографии каждого из них с помощью мобильных телефонов с поддержкой GPS.

Во время каждого мероприятия по сбору данных с участием местных жителей сведения о каждом наблюдении 21 целевого инвазивного вида регистрировались с помощью цифровой формы сбора данных. Участники загружали фотографии, сделанные на мобильные телефоны, и им предлагалось отмечать местоположение на встроенной в форму карте Google, чтобы указать широту и долготу для каждого наблюдения. Форма была разработана на основе формы HISC для сообщений об обнаружении инвазивных видов (HISC pest reporting form).

База данных, созданная и размещённая подразделением вычислительных технологий Гавайского университета на Мауи (UHM), содержит изображения и данные из онлайн-формы, однако эти данные не находятся в открытом доступе. Данные были экспортированы в файлы с разделителями-запятыми (.csv) и переданы четырём аспирантам UHM для проверки таксономических определений на основе предоставленных изображений и описаний. ГИС-аналитик BIISC использовал координаты Google Maps и данные EXIF изображений для проверки качества наблюдений и добавления отсутствующей географической привязки. Ученики-наставники переименовали все файлы изображений в соответствии с номерами наблюдений для их последующего сопоставления в BIISC.

Сбор данных

BIISC планирует сделать все данные проекта общедоступными, опубликовав соответствующие наборы данных через GBIF. В роли специалиста BIISC по информационно-просветительской работе вам необходимо определить соответствующие поля Darwin Core для размещения данных из онлайн-формы. Вы заметили, что аспиранты, выполнявшие проверку данных, добавили в форму дополнительную информацию о видах и местонахождениях. Чтобы учесть эти сведения, необходимо расширить структуру данных и объединить данные из онлайн-формы с добавленной таксономической информацией и географической привязкой.

Управление данными

В течение лета стажёры в главном офисе HISC подготовили таксономические списки на основе исходных данных о находках организмов, собранных и дополненных с помощью онлайн-формы. В роли руководителя проекта HISC вам необходимо провести окончательную проверку качества данных перед их публикацией.

Публикация данных

HISC готов опубликовать данные таксономического списка и связанные с ними данные о находках организмов через GBIF. В этом задании вы возьмёте на себя роль руководителя проекта. Ваша задача — опубликовать очищенный таксономический список и связанные с ним данные о находках организмов в открытом доступе через сеть GBIF.